Centre de ressources

De la microbiologie moléculaire au diagnostic environnemental

• 20/12/2017
• AFES / Ressource technique et scientifique / Webinaires
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Ce webinaire expose les dernières avancées techniques de la microbiologie moléculaire et de la génomique environnementale ainsi que ses récentes applications en termes d’outils de bioindication (et de référentiels associés) dans le domaine du diagnostic de la qualité biologique des sols agricoles et d’environnements naturels. P. Cuny est professeur à Aix-Marseille Université et membre de l’Institut méditerranéen d’Océanologie. Pierre-Alain Maron et Lionel Ranjard sont directeurs de recherche à l’INRA au sein de l’UMR Agroécologie de...

MicroSol database© le Premier Système d’Information Environnemental sur la Microbiologie des Sols

• 01/12/2013
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Un effort scientifique considérable est déployé à l’heure actuelle pour parvenir à améliorer la description et la compréhension du fonctionnement des agro-écosystèmes. Cet effort est motivé par une question centrale : l’action de l’Homme et les modifications climatiques risquent-elles d’engendrer des modifications du fonctionnement de ces systèmes de nature à compromettre leur rôle vis-à-vis des sociétés humaines ? Dans ce contexte la mise au point de descripteurs permettant de rendre compte de l’état biologique et du fonctionnement des sols constitue un enjeu...

La microbiologie moléculaire au service du diagnostique environnemental

• 15/09/2017
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Dans une société où il devient urgent de réduire l’empreinte environnementale des activités humaines, la première étape est de pouvoir faire un diagnostic de la qualité de notre environnement et des différentes matrices qui le constituent (eau, sol, atmosphère). Les micro-organismes, de par leur réponse rapide aux perturbations, leur énorme diversité taxonomique et génétique et leur implication forte dans les cycles biogéochimiques, sont des c, idats sérieux pour élaborer ce diagnostic environnemental. Dans cet article, nous passons en revue les techniques moléculaires...

Interactions entre microbiologie anaérobie et géochimie du sol. Description des dynamiques microbiennes

• 01/12/2005
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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L’anaérobiose dans le sol peut avoir des impacts néfastes sur le sol, la zone non saturée profonde, la nappe, et l’atmosphère. Dans ces conditions, les activités microbiennes sont en étroite interaction avec les transformations géochimiques abiotiques tant au niveau de la solution que des phases solides. Quelques modèles combinent la description des processus microbiens et des transformations géochimiques dans le sol. Jusqu’à présent, les évolutions quantitatives et qualitatives des populations microbiennes n’ont pas été mesurées simultanément pour attester de la...

Impact des digestats de méthanisation sur la qualité microbiologique des sols agricoles : état des connaissances

• 01/02/2023
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Au cours des deux dernières décennies, la production mondiale de biogaz a triplé avec pour objectif de remplacer une partie des combustibles fossiles. Cette production réalisée par digestion anaérobie génère d’importants volumes de sous-produits appelés digestats. Ces derniers peuvent être recyclés dans les sols afin de fertiliser les cultures et de séquestrer du carbone. Leurs répercussions sur la biologie du sol restent toutefois méconnues. Nous proposons une synthèse des connaissances scientifiques actuelles concernant l’impact des digestats de méthanisation...

Atlas Français des bactéries du sol

• 01/01/2018
• Ressource technique et scientifique
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Les chercheurs spécialistes de l’écologie microbienne de l’unité mixte de recherche « Agroécologie », rattachée à l’Inra Bourgogne-Franche-Comté, ont réalisé un inventaire des communautés bactériennes des sols de France. Basé sur les techniques les plus en pointe de séquençage d’ADN, ce travail a débouché sur la réalisation de cet atlas qui nous offre un panorama de ces communautés bactériennes, nous sensibilisant à leur importance dans la qualité et la fertilité des sols.

Cet ouvrage est destiné aux chercheurs, étudiants,...

Introduction à  la science du sol

• 23/01/2001
• Ressource pédagogique
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Cet ouvrage est une référence pour les étudiants qui découvrent la pédologie  et souhaitent connaître les clés de la discipline pour se confronter rapidement à  la réalité du terrain. Il   montre les relations qui existent entre le sol, son environnement et la végétation en s’appuyant aussi bien sur la biologie, la géomorphologie, la physique et la chimie que sur la pédogenèse et les propriétés du sol. Cette  7e édition a été entièrement actualisée  en prenant notamment en compte les progrès de la chimie des humus, les apports récents de la biologie...

Structure et ultrastructure de sols et de organismes vivants

• 01/07/1999
• Ressource technique et scientifique
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De la microscopie électronique conventionnelle aux dernières évolutions technologiques, ce recueil de travaux présente un éventail d’applications à des sujets d’environnement (qualité des sols, pollutions, microbiologie). La microscopie analytique alliée aux traitements quantitatifs statistiques permet de représenter la complexité du milieu vivant en respectant son état initial et en intégrant les changements d’échelle.

Effet du séchage d’échantillons d’un sol ferrugineux tropical sur la détermination de la biomasse microbienne. Comparaison de deux méthodes biocidales de référence

• 01/12/2000
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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La détermination de la biomasse microbienne (BM) est un outil indispensable à l’étude du fonctionnement microbiologie des sols. Les méthodes couramment utilisées imposent des mesures sur sol frais. Cette contrainte est souvent difficile à surmonter lors d’études de terrain. Cette étude a pour objectif de préciser les effets d’un séchage préalable de l’échantillon suivi d’une réhumectation avant la mesure de biomasse microbienne par rapport à une mesure faite sur échantillon frais et d’apporter quelques commentaires comparatifs sur deux techniques biocidales...

Déterminants biologiques du système poral de Vertisols cultivés (Petites Antilles). Conséquences sur la disponibilité de l’eau des sols pour les plantes.

• 01/12/2000
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Cet article sáttache à déterminer le rôle de láctivité biologique dans la dynamique et le fonctionnement du système de porosité de Vertisols des Antilles. Les Vertisols comportent un système de porosité que lón peut schématiser en trois compartiments, différentiant par leur géométrie que par leur mode de formation, et tous trois déformables:
(i) la porosité matricielle (taille 0, 1 à 1 µm), toujours saturée par de léau par ailleurs peu disponible pour les plantes, dont le volume suit la déformation du réseau des argiles,
(ii) la porosité...

Atlas français des bactéries des sols

• 19/04/2019
• AFES / Ressource technique et scientifique / Webinaires
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Battle KARIMI est post-doctorante à l’UMR Agroécologie, équipe Biocom, INRA Dijon

Résumé : Depuis le début des années 2000, l’équipe Biocom de l’INRA de Dijon étudie les communautés microbiennes des sols français via le RMQS. Quinze ans plus tard, cet Atlas des bactéries du sol (Editions Biotope, 2018), unique au monde, dresse un bilan de l’état microbiologique des sols de France. Ce webinaire a pour but de présenter les résultats majeurs sur les bactéries de nos sols et les moyens mis en oeuvre pour produire un tel ouvrage.

Ce...

Analyse de la diversité des sols et des micro-organismes telluriques à l’échelle d’un paysage : approche par cartographie numérique

• 01/12/2016
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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L’Observatoire pérenne de l’environnement (OPE) de l’, RA a mis en œuvre depuis 2007 un réseau d’inventaires et d’observations à long terme des différents milieux de l’environnement sur un territoire de 240 km2 dans les départements de la Meuse et de la Haute-Marne. Un réseau de suivi et d’observation de la qualité des sols a ainsi été mis en place selon un maillage systématique en suivant un protocole d’échantillonnage et d’analyse de type « RMQS » conduit à l’échelle du paysage sur une grille de 1, 5 km x 1, 5 km. Des prélèvements d’échantillons...