MicroSol database© le Premier Système d’Information Environnemental sur la Microbiologie des Sols

Résumé :

Un effort scientifique considérable est déployé à l’heure actuelle pour parvenir à améliorer la description et la compréhension du fonctionnement des agro-écosystèmes. Cet effort est motivé par une question centrale : l’action de l’Homme et les modifications climatiques risquent-elles d’engendrer des modifications du fonctionnement de ces systèmes de nature à compromettre leur rôle vis-à-vis des sociétés humaines ? Dans ce contexte la mise au point de descripteurs permettant de rendre compte de l’état biologique et du fonctionnement des sols constitue un enjeu majeur. Nombre des services assurés par les sols reposent sur l’activité l’abondance et la diversité des communautés microbiennes telluriques ce qui positionne ces paramètres microbiens comme des indicateurs de choix pour rendre compte de l’état biologique des sols. La base de données MicroSol database mise en place au sein de la plateforme GenoSol (INRA Dijon http://www.dijon.inra.fr/plateforme_genosol) constitue un outil opérationnel pour développer ces indicateurs microbiens ainsi que les référentiels indispensables à leur interprétation. En effet cette base de données unique en son genre renferme les résultats des analyses moléculaires de l’abondance et de la diversité des communautés microbiennes acquis dans un cadre méthodologique st, ardisé à partir d’échantillons couvrant la totalité du territoire national. Cet article retrace le contexte de la création de MicroSol database ainsi que les aspects techniques relatifs à l’architecture à la typologie des données et aux fonctionnalités opérationnelles de cette base de données.