Centre de ressources

Micro-organismes

• 01/04/2023
• Ressource pédagogique / Ressource technique et scientifique
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Cette synthèse a été réalisée dans le cadre de la construction du jeu de la Fresque du Sol (https://www.afes.fr/actions/fresque-du-sol/). 35 synthèses ont ainsi été réalisées qui permettent d’aborder les grands enjeux de la connaissance et de la préservation des sols. Cette synthèse porte spécifiquement sur le thème des micro-organismes.

Nous nous nourrissons de la matière organique et participons à sa décomposition. Dans les sols comme dans le corps humain, nous sommes invisibles mais sans nous rien ne...

Mise au point d’outils de prévision de l’évolution de la stabilité de la structure de sols sous léffet de la gestion organique des sols

• 01/12/2011
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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La stabilité structurale est une propriété physique des sols importante indicatrice de leur sensibilité à la battance et à ‘érosion. Les sols limoneux qui couvrent des surfaces importantes en Frances et dans le Nord de l’Europe ont du fait de leur texture et de leur faible teneur en matières organiques une stabilité structurale faible. Dans un contexte où l’on se préoccupe de la diminution de la teneur en matière organique des sols où se développe l’apport de produits résiduaires organiques au sol et où se diversifient les pratiques culturales et les systèmes de...

Comment développer un suivi de la biodiversité des sols français en s’appuyant sur le Réseau de Mesures de la Qualité des Sols (RMQS) ?

• 09/10/2023
• Articles EGS
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Résumé

Pour répondre au besoin de connaissances sur la biodiversité des sols, nous explorons la possibilité d’adosser un suivi de la biodiversité des sols au Réseau de Mesures de la Qualité des Sols (RMQS). Ce couplage a pour objectif de bénéficier du caractère opérationnel du RMQS et de croiser les informations sur la biodiversité avec les données déjà disponibles sur les sols. Des mesures de biodiversité sont d’ailleurs déjà effectuées sur les sites du RMQS. Un groupe de travail incluant des experts nationaux a conçu un questionnaire...

Effets du mode de travail du sol sur les microorganismes à l’échelle du profil cultural

• 01/12/2009
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Le travail du sol modifie la répartition des résidus de culture et la structure du sol et affecte par conséquent les microorganismes du sol (nombre, structure génétiques des populations) ainsi que les fonctions qu’ils assurent au premier rang desquelles la minéralisation de la matière organique. L’objectif est d’étudier l’effet de ces modifications engendrées par deux techniques contrastées de travail du sol : un labour traditionnel (LT) et un travail réduit (TR). Les variables étudiées sont la biomasse microbienne du sol (BM), le potentiel de minéralisation u carbone...

Le RMQS au service de l’écologie microbienne des sols français

• 31/03/2020
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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L’écologie microbienne des sols a longtemps été reconnue comme souffrant d’un certain manque de généricité car les études ont souvent été menées à l’échelle de parcelles voire de petits territoires et avec peu de sites investigués. Il en résulte un manque de connaissances sur les processus de distribution des populations et de la régulation de la diversité microbienne à grane échelle face à des modifications environnementales dues aux usages des terres ou au changement climatique. Dans les années 2000 le RMQS avec 2 240 sites échantillonnés sur toute la France a...

Stocker du C dans les sols : quels mécanismes quelles pratiques agricoles quels indicateurs ?

• 01/12/2016
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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L’initiative internationale “4 pour 1000” a pour ambition de soutenir Etats et acteurs non gouvernementaux dans leurs efforts vers une meilleure gestion des stocks de carbone (C) des sols. Ces stocks dépendent des entrées et sorties de C dans les sols. Les sorties sont la conséquence de mécanismes interconnectés agissant à une échelle spatiale fine qui conduisent au stockage ou déstockage du C présent dans les matières organiques (MO). Il apparaît nécessaire de fédérer les recherches sur ces mécanismes et leur action sur les stocks de C dans un contexte de changement...

Analyse de la diversité des sols et des micro-organismes telluriques à l’échelle d’un paysage : approche par cartographie numérique

• 01/12/2016
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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L’Observatoire pérenne de l’environnement (OPE) de l’, RA a mis en œuvre depuis 2007 un réseau d’inventaires et d’observations à long terme des différents milieux de l’environnement sur un territoire de 240 km2 dans les départements de la Meuse et de la Haute-Marne. Un réseau de suivi et d’observation de la qualité des sols a ainsi été mis en place selon un maillage systématique en suivant un protocole d’échantillonnage et d’analyse de type « RMQS » conduit à l’échelle du paysage sur une grille de 1, 5 km x 1, 5 km. Des prélèvements d’échantillons...

Stockage, recyclage et transformation de la matière organique

• 01/04/2023
• Ressource pédagogique / Ressource technique et scientifique
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Cette synthèse a été réalisée dans le cadre de la construction du jeu de la Fresque du Sol (https://www.afes.fr/actions/fresque-du-sol/). 35 synthèses ont ainsi été réalisées qui permettent d’aborder les grands enjeux de la connaissance et de la préservation des sols. Cette synthèse porte spécifiquement sur le thème du stockage, recyclage et de la transformation de la matière organique.

Le sol et les plantes dépendent l’un de l’autre dans un système vertueux. D’un côté les plantes...

Associations organo-minérales

• 01/04/2023
• Ressource pédagogique / Ressource technique et scientifique
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Cette synthèse a été réalisée dans le cadre de la construction du jeu de la Fresque du Sol (https://www.afes.fr/actions/fresque-du-sol/). 35 synthèses ont ainsi été réalisées qui permettent d’aborder les grands enjeux de la connaissance et de la préservation des sols. Cette synthèse porte spécifiquement sur le thème des associations organo-minérales.

Nous désignons les associations étroites entre les argiles et la matière organique du sol. Nous nous formons parfois naturellement (réactions...

Impact des digestats de méthanisation sur la qualité microbiologique des sols agricoles : état des connaissances

• 01/02/2023
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Au cours des deux dernières décennies, la production mondiale de biogaz a triplé avec pour objectif de remplacer une partie des combustibles fossiles. Cette production réalisée par digestion anaérobie génère d’importants volumes de sous-produits appelés digestats. Ces derniers peuvent être recyclés dans les sols afin de fertiliser les cultures et de séquestrer du carbone. Leurs répercussions sur la biologie du sol restent toutefois méconnues. Nous proposons une synthèse des connaissances scientifiques actuelles concernant l’impact des digestats de méthanisation...

Le Priming Effect dans le sol : mécanismes, acteurs et conséquences sur les services écosystémiques dans un contexte de changement global.

• 28/02/2022
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Le « priming effect » (PE) est un mécanisme clé contribuant au bilan de carbone de l’écosystème sol. Depuis sa découverte en 1926, près de 100 ans de recherche ont conduit à un riche corpus de publications scientifiques pour identifier les déterminants et les mécanismes impliqués. Quelques articles de synthèse ont résumé les connaissances acquises, le dernier datant de 2010. Depuis, les connaissances sur les communautés microbiennes du sol impliquées dans le PE ainsi que dans les mécanismes de séquestration du C se sont considérablement renouvelées. En...

Dynamique des matières organiques des sols, modèles proposés et relations modèles-organismes

• 31/03/2022
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Les modèles de simulations représentent un outil prometteur pour évaluer la dynamique des matières organiques des sols (MOS) à l’aide d’une approche écosystémique. Ils ont le vent en poupe du fait de l’importance des MOS dans les différents cycles biogéochimiques, en lien avec la séquestration du carbone (C), la fertilité des sols et les besoins en eau. Comment prendre en compte la grande diversité des substrats et organismes qui interagissent dans le sol, tout en respectant au mieux le principe de parcimonie nécessaire à la modélisation ? Le présent...

Micro-Organismes et Matière Organique du Sol (modèle MOMOS) – Bilan de 20 ans de modélisation basée sur le traçage isotopique in situ

• 01/12/2009
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Outils prévisionnels de la durabilité des écosystèmes et du changement global, les modèles à compartiments permettant de prédire les flux échangés entre matières organique d’origine végétale ou microbienne du sol ainsi que les transferts vers la phase minérale en direction de l’atmosphère, la biosphère et l’hydrosphère. Sous l’hypothèse du mélange parfait, les traceurs isotopiques permettant la mesure de ces flux avec une valeur initiale connue du contenu de chaque compartiment. La technique d’enfouissement de résidus marqués in situ en sac poreux en échange...

Effet du séchage d’échantillons d’un sol ferrugineux tropical sur la détermination de la biomasse microbienne. Comparaison de deux méthodes biocidales de référence

• 01/12/2000
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La détermination de la biomasse microbienne (BM) est un outil indispensable à l’étude du fonctionnement microbiologie des sols. Les méthodes couramment utilisées imposent des mesures sur sol frais. Cette contrainte est souvent difficile à surmonter lors d’études de terrain. Cette étude a pour objectif de préciser les effets d’un séchage préalable de l’échantillon suivi d’une réhumectation avant la mesure de biomasse microbienne par rapport à une mesure faite sur échantillon frais et d’apporter quelques commentaires comparatifs sur deux techniques biocidales...

Déterminants biologiques de l’agrégation dans les Vertisols des Petites Antilles. Conséquences sur l’érodibilité

• 01/12/2000
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Les Vertisols du Sud-Est de la Martinique, développés sur dépôts volcaniques ont une fragilité physique naturelle liée à leur garniture ioniques relativement riche en sodiumandles Vertisols de la Grane-Terre de la Guadeloupe sont calciques et plus stables physiquement. Ces sols sont actuellement soumis à une agriculture maraîchère intensive, il s’ensuit une forte dégradation physique, surtout en termes d’érosion en nappe pour les Vertisols de Martinique. L’installation de prairies permanentes, irriguées et fertilisées permet d’augmentation rapide et le maintien du...

Les sols et la vie souterraine. Des enjeux majeurs en agroécologie

• 11/05/2017
• Ressource technique et scientifique
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Cet ouvrage regroupe seize chapitres qui présentent et discutent les découvertes récentes sur les sols et les interactions entre plantes et organismes telluriques. L’étude physico-chimique des sols permet de comprendre comment certains de leurs horizons favorisent l’implantation de la faune souterraine (vers de terre, collemboles, acariens…) et, corollairement, comment celle-ci crée de nouveaux espaces, qui seront colonisés par d’autres organismes telluriques, notamment microbiens. La caractérisation des microorganismes des sols par des approches métagénomiques révèle...

La microbiologie moléculaire au service du diagnostique environnemental

• 15/09/2017
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Dans une société où il devient urgent de réduire l’empreinte environnementale des activités humaines, la première étape est de pouvoir faire un diagnostic de la qualité de notre environnement et des différentes matrices qui le constituent (eau, sol, atmosphère). Les micro-organismes, de par leur réponse rapide aux perturbations, leur énorme diversité taxonomique et génétique et leur implication forte dans les cycles biogéochimiques, sont des c, idats sérieux pour élaborer ce diagnostic environnemental. Dans cet article, nous passons en revue les techniques moléculaires...

Statut de la matière organique des sols de la région sahélienne du Burkina Faso

• 01/12/2006
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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L’étude traite de la matière organique de l’horizon supérieur des sols brun rouge subarides, des sols bruns subarides à pseudogley et des sols bruns subarides vertiques, sous formation naturelle. Dans la base de référence mondiale pour les ressources en sols (WRB), ces unités correspondent au niveau des groupes de référence des sols, aux Cambisols et Luvisols. Elles sont localisées dans la région sahélienne du Burkina Faso. Bien que cette partie du pays soit généralement considérée comme une zone de pastoralisme, l’agriculture pluviale d’autosubsistance y est aussi...

Interactions entre microbiologie anaérobie et géochimie du sol. Description des dynamiques microbiennes

• 01/12/2005
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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L’anaérobiose dans le sol peut avoir des impacts néfastes sur le sol, la zone non saturée profonde, la nappe, et l’atmosphère. Dans ces conditions, les activités microbiennes sont en étroite interaction avec les transformations géochimiques abiotiques tant au niveau de la solution que des phases solides. Quelques modèles combinent la description des processus microbiens et des transformations géochimiques dans le sol. Jusqu’à présent, les évolutions quantitatives et qualitatives des populations microbiennes n’ont pas été mesurées simultanément pour attester de la...

Les sols : sources et puits de méthane

• 01/12/2003
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Les sols exondés ou inondés abritent à la fois des populations de bactéries méthanogènes anaérobies responsables de la production de méthane (CH4) et des bactéries méthanotrophes aérobies responsables de son oxydation en CO2. Les sols submergés sont des sources de CH4 où l’émission de ce gaz est la résultante d’une production dans les zones anaérobies et d’une réoxydation importante (60 à > 90 %) dans les zones aérobies que sont la rhizosphère des plantes aquatiques et l’interface sol-eau. Les émissions de CH4 par les sols submergés (rizières zones...