Les protistes dans les sols

Résumé :

Depuis les années 2010, le séquençage à haut-débit a permis la multiplication des études de diversité génomique environnementale dans des milieux variés, générant des descriptions sans précédent des eucaryotes unicellulaires tels que les protistes. Aujourd’hui, les données étant au fur et à mesure croisées, des séquences génétiques appartenant à des lignées initialement considérées comme spécifiques des milieux lacustres ou marins sont retrouvées de manière récurrente dans les sols du monde entier. En conséquence, une question se pose. Les lignées de protistes des sols sont-elles strictement édaphiques ? Les données de la littérature les plus récentes montrent qu’il existe bien des communautés spécifiques des sols, indépendantes de celles des milieux aquatiques environnants. Cependant, certaines lignées majoritairement aquatiques semblent avoir réussi à coloniser les sols et à rester actives.