Dynamique des communautés microbiennes des sols viticoles du Sud de la France : Suivi temporel et stabilité des indicateurs

Résumé :

Ce poster a été présenté aux JES 2025.

La viticulture, essentielle sur les plans économique et culturel en Europe, est fortement impactée par le changement climatique, qui modifie la phénologie du raisin et accroît la sensibilité à la sécheresse, au gel, aux maladies et aux ravageurs. Dans ce contexte, les sols viticoles représentent un levier majeur de résilience : ils contribuent à la notion de terroir et abritent une biodiversité microbienne essentielle au fonctionnement des écosystèmes et à la nutrition hydrominérale des vignes. Grâce aux approches de métagénomique, il est désormais possible de caractériser ces communautés à grande échelle et de mieux comprendre leurs dynamiques.

Nous avons suivi durant quatre hivers (2020–2023) 16 parcelles viticoles conventionnelles à Gaillac afin d’évaluer la stabilité et la composition des communautés microbiennes, ainsi que leur lien avec la composition élémentaire des baies de raisin. Au total, 2 510 OTU bactériens et 2 101 OTU fongiques ont été détectés, avec des variations interannuelles importantes et une hétérogénéité entre parcelles. La richesse spécifique et la composition microbienne montrent un fort turn-over annuel, probablement lié aux pratiques agricoles et aux conditions climatiques. Parallèlement, la composition élémentaire des baies révèle des éléments stables (Sr, Ba, Mn) reflétant le terroir, tandis que d’autres (B, Ca, Zn) covarient significativement avec la richesse microbienne.

Ces résultats suggèrent que la composition élémentaire des raisins pourrait refléter les dynamiques microbiennes des sols, offrant une piste pour relier microbiote, terroir et santé des vignes.