Centre de ressources

Interactions entre microbiologie anaérobie et géochimie du sol. Description des dynamiques microbiennes

• 01/12/2005
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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L’anaérobiose dans le sol peut avoir des impacts néfastes sur le sol, la zone non saturée profonde, la nappe, et l’atmosphère. Dans ces conditions, les activités microbiennes sont en étroite interaction avec les transformations géochimiques abiotiques tant au niveau de la solution que des phases solides. Quelques modèles combinent la description des processus microbiens et des transformations géochimiques dans le sol. Jusqu’à présent, les évolutions quantitatives et qualitatives des populations microbiennes n’ont pas été mesurées simultanément pour attester de la...

Impacts de changements d’occupation et de gestion des sols sur la dynamique des matières organiques les communautés microbiennes et les flux de carbone et d’azote

• 01/12/2011
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Les modes d’occupation des sols et de gestion des terres ont des effets important sur la nature des restitutions organiques et par es techniques culturales qui en découlent sur un certain nombre de facteurs qui affectent les cycles biogéochimiques et les communautés microbiennes du sol Dans ce contexte le projet COSMOS-flux (programme GESSOL2) avait pour objectif d’étudier deux premiers cas d’évolution de la gestion des sols : la conversion labour-non labour (étudiée sur le site Arvalis de Bogneville Essonne sur des parcelles en semis directs depuis 14 ans) et la conversion...

Impact dámendements organiques sur la structure des communautés microbiennes des sols : Choix des méthodes, validation et résultats

• 01/12/2009
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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L’analyse des communautés microbiennes, bactériennes et fongiques présentes dans un sol peut permettre d’évaluer la capacité des écosystèmes à répondre à des changements de conditions environnementales. L’étude présentée ici a pour objectif d’estimer l’impact de produits résiduaires organiques (PRO) de nature différentes sur la structure des communautés microbiennes dans les sols (bactériennes et fongiques, incluant les champignons mycorhiziens) en utilisant deux techniques d’analyse de l’ADN extrait des sols : la PCR-TTGE et la PCR-RFLP. Des échantillons de...

EGS : Sept questions concernant la biodiversité et la gestion des sols

• 30/04/2022
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Un modèle global, simple et consensuel, expliquant le lien entre la biodiversité et le fonctionnement des sols fait encore défaut, malgré une production scientifique en forte croissance dédiée à ce thème. C’est un problème important car cette base est nécessaire pour imaginer et mettre en œuvre les modes de gestion durables du sol de demain, et les communiquer. Les sept questions posées ici ont pour objet de faire avancer la réflexion. Elles concernent des processus encore mal définis, de l’environnement microbien à celui des ingénieurs de l’écosystème...

Biomasse microbienne carbonée et activités enzymatiques : gammes de valeurs obtenues pour différents sols agricoles français et belges

• 26/08/2019
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Depuis plusieurs décennies les micro-organismes du sol ont été identifiés comme des acteurs majeurs du fonctionnement des sols et certaines variables microbiennes (abondance diversité et activités) sont utilisées pour évaluer la qualité biologique des sols. Plus particulièrement les activités enzymatiques d’origine microbienne impliquées dans la minéralisation des matières organiques des sols suscitent un fort intérêt néanmoinsréférentiel n’existe actuellement afin de les utiliser comme des indicateurs prédictifs des fonctions inhérentes à la fertilité des sols...

Micro-Organismes et Matière Organique du Sol (modèle MOMOS) – Bilan de 20 ans de modélisation basée sur le traçage isotopique in situ

• 01/12/2009
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Outils prévisionnels de la durabilité des écosystèmes et du changement global, les modèles à compartiments permettant de prédire les flux échangés entre matières organique d’origine végétale ou microbienne du sol ainsi que les transferts vers la phase minérale en direction de l’atmosphère, la biosphère et l’hydrosphère. Sous l’hypothèse du mélange parfait, les traceurs isotopiques permettant la mesure de ces flux avec une valeur initiale connue du contenu de chaque compartiment. La technique d’enfouissement de résidus marqués in situ en sac poreux en échange...

Le RMQS au service de l’écologie microbienne des sols français

• 31/03/2020
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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L’écologie microbienne des sols a longtemps été reconnue comme souffrant d’un certain manque de généricité car les études ont souvent été menées à l’échelle de parcelles voire de petits territoires et avec peu de sites investigués. Il en résulte un manque de connaissances sur les processus de distribution des populations et de la régulation de la diversité microbienne à grane échelle face à des modifications environnementales dues aux usages des terres ou au changement climatique. Dans les années 2000 le RMQS avec 2 240 sites échantillonnés sur toute la France a...

ECOMIC-RMQS : biogéographie microbienne à l’échelle de la France – Etat d’avancement et premiers résultats

• 01/12/2009
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Le Réseau de Mesures de la Qualité des Sols (RMQS = réseau de surveillance français de la qualité des sols coordonné par l’unité InfoSol de l’INRA d’Orléans – GISSOL) repose sur une grille d’échantillonnage systématique (16×16 km) couvrant l’ensemble du territoire français soit un total de 2 200 échantillons de sols prélevés sous différentes conditions environnementales (caractéristiques pédo-climatiques mode d’occupation des sols…). Ce réseau constitue un bon outil d’évaluation et de suivi de la qualité des sols et de caractérisation des niveaux...

Effet du séchage d’échantillons d’un sol ferrugineux tropical sur la détermination de la biomasse microbienne. Comparaison de deux méthodes biocidales de référence

• 01/12/2000
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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La détermination de la biomasse microbienne (BM) est un outil indispensable à l’étude du fonctionnement microbiologie des sols. Les méthodes couramment utilisées imposent des mesures sur sol frais. Cette contrainte est souvent difficile à surmonter lors d’études de terrain. Cette étude a pour objectif de préciser les effets d’un séchage préalable de l’échantillon suivi d’une réhumectation avant la mesure de biomasse microbienne par rapport à une mesure faite sur échantillon frais et d’apporter quelques commentaires comparatifs sur deux techniques biocidales...

La biodiversité des sols : un fantastique patrimoine à préserver

• AFES / Ressource technique et scientifique / Webinaires
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P. Lemanceau est directeur de Recherche à l’INRA de Dijon et directeur de l’UMR d’Agroécologie de Dijon.

La présentation s’inscrit dans une perspective de développement de l’agroécologie et de valorisation des services écosystémiques des sols. Un rappel des progrès récents en termes de caractérisation de la biodiversité microbienne des sols introduira la conférence. Les possibilités actuelles de diagnostic de la qualité biologique des sols seront ensuite présentées et, sur cette base, les perspectives de recommandation en terme...

Apprentissage par la recherche à l’Université de Montpellier : Etude de la biodiversité microbienne du sol de la réserve naturelle du Lunaret.

• 30/04/2022
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Le sol constitue un écosystème extrêmement riche et abondant en termes d’organismes microscopiques jouant un rôle majeur dans les cycles biogéochimiques. De nombreux facteurs peuvent perturber la composition de ces écosystèmes, entraînant des conséquences sur l’environnement, voire sur la santé humaine et animale. Cet article présente le travail réalisé par des étudiants du master Interactions Microorganismes Hôtes Environnement (IMHE) de l’Université de Montpellieran dans le cadre d’une approche de formation par la recherche encadrée par leurs enseignantes. Le...

Influence des racines sur la stabilité structurale d’un sol du Nord de la Tunisie

• 01/12/2011
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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La présence de la plante affecte l’état structural du sol et sa résistance à l’érosion hydrique. L’objectif de ce travail était de déterminer l’influence de deux cultures (blé dur et féverole) sur la stabilité des agrégats d’un sol limono-argileux du Nord de la Tunisie en relation avec l’activité racinaire et microbienne dans le sol. Des essais en pots de végétation en conditions semi-contrôlées de serre ont été menés en 2008. Les suivis de la stabilité des agrégats vis-à-vis du test à l’eau, de la densité des racines, de la teneur e polysaccharides et...

Azote minéralisable et statut organique Azote minéralisable et statut organique des Andosols de Guadeloupe – Influence du milieu et des pratiques culturales.

• 01/12/2005
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Les Andosols de Guadeloupe présentent des teneurs en matière organique très variables. Ces variations peuvent être liées à celles des conditions pédo-climatiques ou à l’effet des pratiques culturales. Dans un contexte où la limitation des pollutions d’origine agricole implique une réduction de la fertilisation azotée, les conséquences de ces variations sur la quantité d’azote minéralisable doivent être prises en compte pour évaluer la fertilité des sols et la durabilité des systèmes de cultures. Après avoir étudié les variations du statut organique des Andosols...

MicroSol database© le Premier Système d’Information Environnemental sur la Microbiologie des Sols

• 01/12/2013
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Un effort scientifique considérable est déployé à l’heure actuelle pour parvenir à améliorer la description et la compréhension du fonctionnement des agro-écosystèmes. Cet effort est motivé par une question centrale : l’action de l’Homme et les modifications climatiques risquent-elles d’engendrer des modifications du fonctionnement de ces systèmes de nature à compromettre leur rôle vis-à-vis des sociétés humaines ? Dans ce contexte la mise au point de descripteurs permettant de rendre compte de l’état biologique et du fonctionnement des sols constitue un enjeu...

Déterminants biologiques de l’agrégation dans les Vertisols des Petites Antilles. Conséquences sur l’érodibilité

• 01/12/2000
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Les Vertisols du Sud-Est de la Martinique, développés sur dépôts volcaniques ont une fragilité physique naturelle liée à leur garniture ioniques relativement riche en sodiumandles Vertisols de la Grane-Terre de la Guadeloupe sont calciques et plus stables physiquement. Ces sols sont actuellement soumis à une agriculture maraîchère intensive, il s’ensuit une forte dégradation physique, surtout en termes d’érosion en nappe pour les Vertisols de Martinique. L’installation de prairies permanentes, irriguées et fertilisées permet d’augmentation rapide et le maintien du...

Atlas Français des bactéries du sol

• 01/01/2018
• Ressource technique et scientifique
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Les chercheurs spécialistes de l’écologie microbienne de l’unité mixte de recherche « Agroécologie », rattachée à l’Inra Bourgogne-Franche-Comté, ont réalisé un inventaire des communautés bactériennes des sols de France. Basé sur les techniques les plus en pointe de séquençage d’ADN, ce travail a débouché sur la réalisation de cet atlas qui nous offre un panorama de ces communautés bactériennes, nous sensibilisant à leur importance dans la qualité et la fertilité des sols.

Cet ouvrage est destiné aux chercheurs, étudiants,...

Les sols et la vie souterraine. Des enjeux majeurs en agroécologie

• 11/05/2017
• Ressource technique et scientifique
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Cet ouvrage regroupe seize chapitres qui présentent et discutent les découvertes récentes sur les sols et les interactions entre plantes et organismes telluriques. L’étude physico-chimique des sols permet de comprendre comment certains de leurs horizons favorisent l’implantation de la faune souterraine (vers de terre, collemboles, acariens…) et, corollairement, comment celle-ci crée de nouveaux espaces, qui seront colonisés par d’autres organismes telluriques, notamment microbiens. La caractérisation des microorganismes des sols par des approches métagénomiques révèle...

Effets du mode de travail du sol sur les microorganismes à l’échelle du profil cultural

• 01/12/2009
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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Le travail du sol modifie la répartition des résidus de culture et la structure du sol et affecte par conséquent les microorganismes du sol (nombre, structure génétiques des populations) ainsi que les fonctions qu’ils assurent au premier rang desquelles la minéralisation de la matière organique. L’objectif est d’étudier l’effet de ces modifications engendrées par deux techniques contrastées de travail du sol : un labour traditionnel (LT) et un travail réduit (TR). Les variables étudiées sont la biomasse microbienne du sol (BM), le potentiel de minéralisation u carbone...

Statut de la matière organique des sols de la région sahélienne du Burkina Faso

• 01/12/2006
• Articles EGS / Ressource technique et scientifique
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L’étude traite de la matière organique de l’horizon supérieur des sols brun rouge subarides, des sols bruns subarides à pseudogley et des sols bruns subarides vertiques, sous formation naturelle. Dans la base de référence mondiale pour les ressources en sols (WRB), ces unités correspondent au niveau des groupes de référence des sols, aux Cambisols et Luvisols. Elles sont localisées dans la région sahélienne du Burkina Faso. Bien que cette partie du pays soit généralement considérée comme une zone de pastoralisme, l’agriculture pluviale d’autosubsistance y est aussi...

EGS : Bilan des 20 premières années des productions scientifiques du Réseau de mesures de la qualité des sols (RMQS)

• 12/06/2023
• AFES
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Résumé 

Le Réseau de mesures de la qualité des sols (RMQS) est un programme d’échantillonnage
et d’analyse de sols français en place depuis 2000, constitué de 2240 sites. Une nouvelle
campagne d’échantillonnage est prévue tous les quinze ans afin de suivre l’évolution de la
qualité des sols. La première campagne et la moitié de la deuxième campagne, actuellement
en cours, ont permis la collecte et le stockage de 36000 échantillons. L’évaluation et le suivi de
la qualité des sols sont fondés sur l’analyse...