L’analyse de la nématofaune, un indicateur opérationnel et en déploiement pour caractériser l’état biologique des sols

Résumé :

Le rôle fondamental de la biodiversité des sols pour leur fonctionnement et leur productivité est désormais bien établi. La prise en compte de cette composante biologique est nécessaire pour réaliser des diagnostics de la qualité des sols. Pour cela, les praticiens requièrent des indicateurs opérationnels et facilement interprétables pour une meilleure appropriation des résultats.
La nématofaune (= ensemble des nématodes du sol) présente des propriétés qui en fait un indicateur biologique (= Bioindicateur) privilégié pour l’étude des sols de la quasi-totalité des milieux naturels, agricoles et anthropisés. Les nématodes sont des vers ronds microscopiques, présents dans tous les sols avec des communautés abondantes et diversifiées. Les nématodes ont des comportements alimentaires variés (phytophages, bactérivores, fongivores, carnivores) qui leur conférent une capacité à représenter la micro-chaîne trophique des sols et ainsi un lien fort avec l’activité et les fonctions biologiques du sol (e.g. Recyclage des nutriments, transformation du carbone, régulations biologiques). De nombreuses études révèlent une sensibilité de la nématofaune du sol à l’usage des sols, à la plupart des pratiques agricoles, aux pollutions chimiques, aux méthodes de réhabilitation des sols et plus largement aux changements climatiques. Par ailleurs, la méthodologie d’extraction et d’étude de ces organismes est normée, permettant une répétabilité et une robustesse des résultats.
Dans cet article, nous présentons les gammes de variation d’une sélection de paramètres de la nématofaune dans divers contextes d’usage du sol en France entière (hors outre-mer) à partir de plus de 6000 analyses extraites de la base de données ELIPTO®, recueillies par ELISOL environnement. L’analyse de ces données met en avant un effet prépondérant de l’usage du sol (cultures annuelles, surface en herbe, surfaces boisées, vignes et vergers) sur les divers paramètres de la nématofaune. Une démarche pour le développement de référentiels d’interprétation combinant analyses statistiques et expertise est présentée, permettant la transformation des variables biologiques en scores (notes entre 0 et 10). Enfin, les méthodes en développement qui permettront d’automatiser la caractérisation des communautés de nématodes sont évoquées ; cette automatisation va permettre un déploiement à large échelle de cet outil d’évaluation de l’état biologique des sols.